O Mestrado em Engenharia Alimentar tem como objetivo:

- Proporcionar formação avançada de índole profissionalizante na Área CNAEF 541.

- Formar técnicos superiores especializados em tecnologias aplicadas na primeira e segunda transformação

- Conferir preparação a nível superior a técnicos para laboratórios da indústria.

- Conferir preparação a nível superior a técnicos para centros de investigação.

- Formar técnicos superiores especializados no âmbito da distribuição controlo.

- Proporcionar formação avançada em segurança e rastreabilidade dos alimentos.

- Formar técnicos superiores com capacidade de coordenação e execução de projetos.