O Museu Botânico do Instituto Politécnico de Beja, fundado no dia 2 de Outubro de 2002, é um centro de cultura científica no qual se estudam e conservam objectos naturais (sementes, frutos, folhas, flores, etc.), matérias-primas (resinas, gomas, óleos, etc.) e artefactos criados a partir de matérias-primas de origem vegetal (etnobotânica).

O Museu Botânico mantém um programa anual de exposições e de cursos de curta duração, que desenvolve em Beja, e outros locais do país, com o objectivo de divulgar e valorizar o património etnobotânico português e de outras nações.

Em 2003, o Museu Botânico foi agraciado com dois Prémios da Fundação Ford, entre os quais o Grande Prémio e foi selecionado pela Comissão Nacional para a UNESCO, para representar Portugal perante o Júri do Prémio Sultão Qaboos.